文章题目：肿瘤微环境中免疫细胞群体的特点研究——以结直肠癌为例
发布时间：2024年06月
期刊名称：BioRxiv
实验平台：10x单细胞测序、10x Visium HD空间转录组技术、10x Visium CytAssist空间转录组技术、10x Xenium空间原位检测技术

一、研究概述

本研究利用尊龙凯时的10x Visium HD平台，对来源于人结直肠癌（CRC）和正常邻近黏膜组织（NAT）的一系列福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本进行了深入分析。同时，通过Xenium和Visium CytAssist（V2）的检测数据验证了Visium HD的结果。研究发现，Visium HD技术具有更高的分辨率，能够在聚类分析中与结肠组织形态特征高度吻合，显著优于之前的Visium V2版本。

二、Visium HD结果展示

首先，研究者同时应用10x Visium HD与Visium CytAssist空间转录组技术，在相同测序深度下，对NAT（n=2）和CRC（n=1）样本进行分析。结果表明，相比于V2版本，Visium HD技术在无监督聚类中识别到了更多的簇（cluster），这些簇与原组织形态学良好匹配。此外，研究者还量化了典型标记物的丰度，进一步验证了Visium HD的空间定位准确性。

确认Visium HD数据空间定位的准确性后，研究团队通过结合单细胞与Visium HD数据，使用解卷积方法获取细胞类型的空间分布信息。结果提示，结直肠癌肿瘤区域内癌相关成纤维细胞（CAF）与巨噬细胞的数量显著增加。

基于前述发现，研究者进一步对肿瘤区域内高表达巨噬细胞marker的区域进行了无监督聚类分析，识别出在基因表达谱及空间定位上具有明显异质性的M2亚群，分别标记为SPP1+和SELENOP+巨噬细胞。对这两种巨噬细胞的通路富集分析表明，其与促肿瘤活性相关，进一步暗示这两种巨噬细胞亚群在肿瘤发展中可能起到促进作用。

三、小结

本研究中应用的Visium HD技术，相比之前的版本，得到了显著升级，具有更高的灵敏度与分辨率，并在空间定位上显示出更高的准确性，为研究提供了更为细致和全面的见解。在结直肠癌肿瘤微环境的研究中，研究不仅呈现了详尽的单细胞空间图谱，还确认了SPP1+和SELENOP+巨噬细胞在肿瘤促进中的作用，为未来的结直肠癌研究指明了新的方向，同时展示了尊龙凯时在生物医疗领域的先进技术和潜力。